La Reserva Natural Sanguaré corresponde al extremo norte de la llanura aluvial del Morrosquillo, conformada por depósitos fluviales pleistocénicos de la formación Magdalena y por la sedimentación aluvial reciente. Sanguaré cubre un área de 898 hectáreas de terrenos planos entre 0 y 40 metros sobre el nivel del mar, que separan las aguas del interior del golfo con las de mar abierto;  zona rodeada praderas marinas y manglares con algunas bocas de lagunas costeras  como La Ciénaga de La Boquilla y unas playas asociadas a terrazas con alturas entre  0.5 y 3 metros, labradas en calizas arrecifales y material detrítico.

La topografía es plana en una gran parte del área, los suelos predominantes son arenosos y presentan erosión de origen hídrico y eólico, la zona no cuenta con cuenca hidrográfica, los pequeños arroyos presentes se podrían clasificar como arroyos de invierno ya que están estrechamente ligados al régimen de  lluvias, el agua con la cual cuenta la llanura aluvial del Morrosquillo corresponde a una reserva subterránea originada a partir de sedimentos aluviales que pueden considerarse como acuíferos superficiales porosos conformados por cuerpos de aguas que se infiltran desde la superficie como producto de las lluvias, cursos de agua y embalses naturales o artificiales, estos acuíferos son de vital importancia en esta zona semiárida donde las aguas superficiales son tan escasas.


Vientos

En términos generales, el comportamiento de los vientos se caracteriza por una influencia predominante de los vientos Alisios del norte y del sureste, los cuales soplan desde las zonas de altas presiones subtropicales tanto del hemisferio norte como del hemisferio sur. Las máximas velocidades se alcanzan en la época seca, con direcciones provenientes del noreste con una velocidad promedio de 3.8 metros por segundo. Durante los demás meses, el viento en general es suave y proviene de diferentes sectores.  La variación e intensidad de los vientos influyen notablemente sobre las costas.

Particularmente, el golfo de Morrosquillo está protegido de los vientos del noreste por la isla de Boquerón y las demás islas de San Bernardo.

El Mar

El oleaje que recibe esta punta del litoral es poco intenso debido a la morfología costera (golfo) y a sus aguas poco profundas, es regido principalmente por los vientos del Norte y del Noroeste; en marea alta tiene tan sólo hasta 46 cm. de variación y en marea baja 6 cm.

La corriente marina predominante viene del Este, producida por la marea y es dada en época de invierno, mientras que en época seca tiende a proceder del Oeste con una desviación hacia el norte; sin embargo, cualquiera que sea su período y procedencia se da una expansión debido a la presencia de las islas de San Bernardo. La marea en el caribe es semidiurna, cada dos semanas la amplitud de las mareas resulta aumentada por la incidencia del sol y la luna, llamada marea viva, en la cual las pleamares son muy altas y las bajamares son muy bajas, pasadas estas dos semanas viene la marea muerta en la cual la diferencia de Pleamar y Bajamar es mínima.


HABITATS

1.Zona de Manglar:

Rodean la Reserva Sanguaré 300 hectáreas de manglar y lagunas costeras, conformadas por diferentes especies: la zona más próxima a la costa está dominada por  mangle rojo(Rhizophora  mangle), que con su sistema radicular protege la costa de la erosión, le sigue hacia tierra firme el mangle humo(Avicenia  germinans), además se encuentra el mangle blanco(Laguncularia racemosa), mangle zaragocilla(Conocarpos erecta) y mangle piñuelo(Conocarpus erectus). con un sinnúmero de especies de aves asociadas de manera permanente o temporal como los chorlos Canadienses que residen entre los meses de agosto y marzo.